六龟区温泉业者争取合法化经营15年，许多业者撑不下去，最后有14家纳入政府辅导合法化方案名单，但因早期大部分业者承租国有地经营温泉，现在土地无法专案让售，业者即便合法化也无法申请建筑融资来开发，盼政府专案让售协助解决困境。
六龟温泉业早期因违反水源保护区、建筑法规遭前高雄县政府陆续取缔祭出断电、断水措施，让业者深感不安，为此筹组六龟观光协会，团结各家业者向政府单位争取温泉合法化。
2001年10月，交通部观光局茂林国家风景区管理处成立即拟订政策协助辅导业者合法化，2年后，由行政院专案核定辅导合法化方案，原受辅导有39家，但经历莫拉克风灾后，因地形地貌改变而暂停辅导合法化行政程序。
2010年行政院核定合法化方案，业者不论原审查进度均须减量开发修正各项计画后，通过安全评估才能继续原地开发，且因开发内容变更，后续审查均需重审，至今有14家办理合法化。
宝来温泉业者简铭辰指出，早期大部分业者承租国有地来经营温泉，现在面临土地无法专案让售，即便温泉合法化后，业者无法向银行申请建筑融资，根本没有足够资金来依计画进行开发。
高市府观光局表示，受辅导温泉业者有2家，因原先有缴保证金获国有财产署同意土地让售，其余未缴保证金业者以承租土地受委托方式经营。
茂管处副处长李易苍说，莫拉克风灾后，中央新增许可开发范围国有非公用土地不得让售规定，将以泛舟结合温泉来拉人气
